商业保险不可以赔付孤独症，但基本医保可以保孤独症。
1.商业保险不可以赔付孤独症。因为孤独症大多属于遗传性疾病，而且也属于精神类疾病的一种，更多的是心理上的问题，因此属于商业保险的免责范围，商业保险是不保的，包括商业医疗险、重疾险、意外险都不保。
2.基本医保可以保孤独症，但不是因为孤独症而产生的所有费用都可以报销，具体还应当以当地政策为准，比如：
（1）以大连为例：大连市人社局规定，将少儿孤独症、小儿脑性瘫痪及精神分裂症等3种精神类残疾疾病，纳入城镇居民医保门诊大病管理。参加大连市城镇居民基本医保的0-14周岁未成年居民中，如果经过检诊认定并取得残疾证的少儿孤独症、小儿脑性瘫痪 患儿，在二级以上医保定点医疗机构门诊，进行康复、诊断评估及相关药物治疗等发生的医疗费用，均可纳入城镇居民医保统筹基金予以报销，门诊治疗不设起付线，统筹报销75%，年度最高支付限额4800；
（2）以南通市为例：一旦经过专业医疗机构评估认定具有康复训练适应指征的0—14周岁残疾儿童，可到户籍所在地残联申请基本康复服务，每年可享受22600的医保报销费用；
（3）以山东为例：凡是参加山东省居民基本医保的0-17周岁的脑瘫等残疾儿童和孤独症儿童都可以享受相关医保待遇，且将国家规定的29项医疗康复项目全部纳入医保支付，而且符合规定的医疗康复项目治疗费、必要的检查检验、药品等费用也都纳入到了医保门诊支付并按照门诊慢病管理，比如青岛对于孤独症儿童日间康复定点医疗机构实行床日限额结算，并纳入总额控制预算，一级医院每日限额140、二级医院每日限额160、三级医院每日限额200。