医保中断账户余额不见了有如下情况：
1、投保人所缴纳的医保不是职工医保，或者说以灵活就业人员缴纳但是没有达到可以存储个人账户余额的标准，因此原本就没有个人账户余额存在。
2、在医保中断之前投保人已经将账户余额里的费用用完了，因此账户当中没有可剩下的钱。
3、系统出险错误，有时候社保系统缴纳人数过大，导致系统没有及时的处理，出现信息更新延误或者较慢导致账户没有余额，可以刷新或者隔段时间再查看。
4、查询方式不对：医保卡分为个人账户和金融账户，在查询时，投保人应该要查询个人账户里的余额。
5、医保机构还未划账∶如果拿到医保卡时间不长，查余额时显示为零，可能是医保机构还没有正式转账，耐心等待。