不同地区的合作医疗报销比例有所差异，此处以长沙为例：
一：门诊。
（1）村卫生室：医院支付比例70%，参保居民支付30%；
（2）乡镇卫生院、社区卫生服务中心：医院支付比例60%，参保居民支付40%；
（3）院校医院或医务室：医院支付比例70%，参保大中专学生、以学校为单位整体参保的普通学生自负30%；
（4）一个结算年度内发生的政策范围内门诊医疗费用最高支付限额为800。
二：住院。
（1）乡镇卫生院、社区卫生服务机构：起付标准200，可报销85%；
（2）三类收费标准医疗机构、县级二类收费标准医疗机构：起付标准300，可报销70%；
（3）其他二类收费标准医疗机构：起付标准500，可报销60%；
（4）市级一类收费标准医疗机构：起付标准1100，可报销60%；
（5）一个结算年度内，累计最高支付限额为15万。
三：生育。
（1）平产，最高可补助1300；
（2）剖宫产，最高可补助1600；
（3）孕产妇因为高危重症救治而发生的政策范围内住院医疗费用，可参照疾病住院的相关标准进行报销支付；
四：大病医疗。
（1）普通群众：起付标准为22324，0至3万（含）部分可报销60%、3万至8万（含）部分可报销65%、8万至15万（含）部分可报销75%、15万以上可报销85%，年度限额统一为40万；
（2）困难群众，包括特困人员、低保对象、返贫致贫人口，起付线为11165，0至3万（含）部分可报销65%、3万至8万（含）部分可报销70%、8万至15万（含）部分可报销80%、15万以上可报销90%，无封顶。