新生儿医保卡和少儿互助基金的区别：
1.新生儿医保是我国的一项基本医疗保障，是针对新生儿在保险报章内产生的住院、治疗、手术等医疗费用的保障。少儿互助基金是由人民政府组织、卫生行政部门牵头设立的非营利性社会公益基金；
2.新生儿医保卡的参保对象是所有未成年的少年儿童，少儿互助基金的参保对象是具有居住地户口、居住证在1个月以上18岁以下的儿童；
3.少儿互助基金50%由家长自理，50%有基金按规定分级支付报销，新少儿医保由个人先行垫付承担，然后再按不同比例和报销标准进行比例报销。
新生儿医保卡和少儿互助基金并不冲突，两者都是对少儿医疗保险的有效补充，如果为了对孩子有更多方面的保障，可以通过商业医疗保险对其进行补充。