灵活就业医保和居民医保的区别主要就在于：
1、缴费方式不同
以灵活就业人员的身份去缴纳医保，参保人员可以自行选择缴费方式，可以按月缴费，也可以按年缴费。而参保居民医保的话，那通常就是一年一交。
2、参保对象不同
灵活就业医保主要针对的是那些从事非全日制工作，或者临时工作、弹性工作的人员；而居民医保针对的则是那些没有参加职工医保的城乡居民（包括有未成年人、无工作人员、农民等等）。
大家还需要注意，以灵活就业人员的身份去缴纳医保，其实既可以选择缴纳职工医保，也可以选择缴纳居民医保。
另外，因为社保分地区统筹，所以不同参保地的灵活就业医保和居民医保都有可能存在一定的差别，相关规定可能会有所不同。具体可以去咨询一下当地社保中心的工作人员。