个体工商户办理清税证明的流程通常包括以下步骤：
1. 确认是否符合简易注销条件：如果个体工商户领取营业执照后未开展经营活动（未开业），或者申请注销登记前未发生债权债务或已将债权债务清算完结，则可以判断为简易注销。
2. 公示简易注销公告：如果符合简易注销条件，个体工商户需要在公示系统填报简易注销公告。
3. 准备相关材料：包括法人身份证复印件、营业执照正副本、经办人身份证复印件、法人委托授权书等。
4. 进入税务局网站申请：登录所在地税务局的网站，找到个体工商户清税证明的申请入口，填写申请表格并上传相关材料。
5. 缴纳申请费用：根据税务局的要求缴纳相关的申请费用。
6. 等待审核：提交申请后，耐心等待税务局的审核，通常会在一周内完成。
7. 领取清税证明：审核通过后，个体工商户可前往税务局领取个体工商户清税证明。
需要注意的是，如果个体工商户未办理过涉税事宜或办理过涉税事宜但未领用发票、无欠税（滞纳金）及罚款，可以免予到税务机关办理清税证明。此外，如果不符合简易注销条件，可能需要按照一般注销程序进行，这通常涉及更复杂的税务清算和证明文件。