二者的区别在于缴纳对象不同、缴存范围不同和缴存比例不同。
1、缴存对象不同：住房公积金是由单位为职工缴纳的，并且只能是单位缴纳，个人无法办理住房公积金；而补充住房公积金是由个人负责，一般是单位从职工的个人工资中直接代扣。住房公积金属于强制性缴纳，而补充住房公积金属于自愿缴纳。
2、缴存范围不同：住房公积金是各类企业中的职工都需要缴纳，个人和公司是按一定的比例缴纳个人公积金；而补充住房只有组合缴纳税款的企业和自收自支的事业单位以及其所属的职工可以参加补充住房公积金，补充住房公积金的缴存范围在住房公积金的缴存范围基础中增加了一定的限制条件。
3、缴存比例不同：住房公积金的缴存比例是单位和个人各占比7%，并且缴存额度有一定的限制；而补充住房公积金的缴存比例分别是在不大于各5%不小于各1%的范围内，由单位自由确定，对于缴纳额度也没有限制要求。
补充住房公积金是什么意思？
补充公积金制度是住房公积金制度的一种补充，两者的基本特征是相同的，都是一种长期的住房公积金，是用于职工的住房消费，属于职工个人所有。补充住房公积金属于强制性缴纳的社会保障项目，企业根据自身的业绩和管理需要可以自主决定是否替员工缴纳补充住房公积金。
